Подготовка научно-педагогических и научных кадров ведется 34 научными школами академии, одна из которых, научная школа военно-прикладной геофизики, представлена на соискание гранта Президента РФ для поддержки ведущих научных школ нашей страны.
Основными направлениями работы научных школ являются:
- Оперативное искусство и тактика;
- Радиационная, химическая, бактериологическая защита;
- Исследование технологических и эксплуатационных характеристик конструкционных материалов;
- Баллистическое обеспечение и теория полётов;
- Эксплуатация программного обеспечения и защиты информации вычислительных комплексов;
- Статистическая радиолокация и радионавигация;
- Прикладная геофизика;
- Теория управления и системный анализ.